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全基因组甲基化测序技术介绍
***************************************************************************************************** 技术简介： 全基因组重亚硫酸盐测序（whole genome bisulfite Sequencing）是基于重亚硫酸盐的甲基化分析方法，首先通过重亚硫酸盐对样本DNA进行处理，将未甲基化的C碱基转化为U碱基，而甲基化的C碱基则不会改变，进行PCR扩增后U碱基会变成T，与原本甲基化的C碱基区分开，再结合高通量测序技术，可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。 应用领域：
技术参数与实验流程
***************************************************************************************************** 技术参数
实验流程 A. 建库测序流程  B. 数据分析流程 
经典文章解读 背景：番茄果实的成熟是由植物激素乙烯引发，但它的影响受一个未知的发育线索所限制，为了确定这个未知的发育线索是否涉及表观遗传重塑，本研究对番茄用甲基转移酶抑制剂处理，结果发现果实提前成熟。通过对对果实发育中从不成熟到完全成熟的4个阶段番茄果实进行全基因组甲基化测序，数据表明，表观基因组在果实发育过程中不能是静态的，可能已被选择用于确保发育过程的保真度。 方法： 研究人员对果实发育中从不成熟到完全成熟的4个阶段番茄果实（17d，39d，42d，52d），2个成熟缺陷变异株 (Cnr和rin变异) 的成熟期果实和1个野生型番茄叶片进行全基因组甲基化测序，测序深度为10×。 结果：
参考文献： Zhang S., et al., Single-base resolution methylomes of tomato fruit development reveal epigenome modifications associated with ripening. Nature biotechnology, 2013 Feb;31(2):154-9.  
图一： 番茄的表观基因组图谱
图二：不同组织、发育时期的甲基化差异
 
图三： RIN结合位点区域特征
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