CNVplex^®采用连接酶高特异性连接反应对目的区域进行杂交、连接，通过专利技术在连接探针末段引入不同长度的标签序列获得长度各异的目的探针连接产物，利用荧光标记的通用引物对连接产物进行PCR扩增，通过荧光毛细管电泳对扩增产物进行电泳分离检测，最后通过对电泳图谱的分析获取各个位点的峰高，进而对样品目的区域的拷贝数进行分析确定。
拷贝数计算：
1）输出每个峰高数值（H值），如图中H(T1), H(R), H(T2)
2）计算各个目标区峰相对参照峰的比值（R值），如R(T1)= H(T1)/ H(R)
3）将检测样本的各个目标区R值除以对照样本的相应目标区R值（RR值）再乘以对照样本该目标区的拷贝数（通常为2）即获得检测样本各个目标区的拷贝数, 如检测样本RR(T1)=0.5，但如果对照样本RR(T1)=1，而T1在对照样本中的拷贝数为2，则检测样本数T1的拷贝数=0.5/1×2=1
 
 
                                                                  图1） CNVplex^TM原理图
 
应用领域：
       本方法适用于各个涉及到DNA拷贝数变异研究的遗传研究领域，例如疾病基因组研究、肿瘤基因组研究、临床分子诊断研究、植物基因组研究、动物基因组研究等。尤其适合针对较大候选区域、检测密度要求较高的DNA拷贝数分析，以及全基因组CNV研究后进行进一步的大样品验证研究。