课题背景：多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome，PCOS）是一组复杂的症候群，是因月经调节机制失常导致，临床表现为慢性无排卵、月经稀发、闭经或月经不调、多毛、肥胖、不孕、卵巢多囊性增大。此综合征在1935年由Stein及Leventhal首次报道，故又称之为S -L综合征（Stein-Leventhal syndrome）,好发于青春期及生育期妇女。PCOS的病因复杂，一般认为与下丘脑-垂体-卵巢轴功能失常、肾上腺功能紊乱、遗传、代谢等因素有关。少数PCOS患者有性染色体或常染色体异常，有些还有家族史。2010年12月，来自山东大学，山东再生医学研究重点实验室，上海交通大学，复旦大学等处的研究人员发表了世界上首个PCOS的全基因组关联分析（GWAS）结果，并发现了3个相关的易感位点：2p16.3 (rs13405728，P= 7.55 × 10-21, OR= 0.71)；2p21 (rs13429458, P = 1.73 × 10-23, OR= 0.67)；9q33.3 (rs2479106, P = 8.12 × 10-19, OR= 1.34)。这为研究和认识该疾病的发病机制打下了很好的基础。该研究成果公布在Nature Genetics杂志上。

所用关键技术：SNP芯片、SNP分型。此次研究用于SNP芯片分型的样本数是744例PCOS样本 vs 895例正常样本。上海天昊目前在芯片分型及后期数据分析方面都能协助客户很好地完成。另外，此次研究用于芯片后续验证的大样本分别来自两个不同地区的队列，总共近万人，上海天昊的专利技术SNPscan是目前市场上对于样本量大于1000，SNP位点数在48个及其整倍数的SNP分型实验中，成本最低的技术，而其成功率和准确性也能保证在百分之九十几以上。

课题结果和讨论，意义：此次研究结果不但有助于研究者们深入解析PCOS的发病机制，而且为其风险预测、早期防治以及为新型高效药物的筛选提供了理论依据和生物靶标。同行研究者除了在不同地区中加大样本量进行上述三个位点的验证工作外，还可以在这三个易感基因座中挑选感兴趣的基因进行功能研究。

参考文献：Genome-wide association study identifies susceptibility loci for polycystic ovary syndrome on chromosome 2p16.3, 2p21 and 9q33.3. Chen Z.J., Zhao H., He L., etal；Nat Genet. 2010.

Abstract Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a common metabolic disorder in women. To identify causative genes, we conducted a genome-wide association study (GWAS) of PCOS in Han Chinese. The discovery set included 744 PCOS cases and 895 controls; subsequent replications involved two independent cohorts (2,840 PCOS cases and 5,012 controls from northern Han Chinese; 498 cases and 780 controls from southern and central Han Chinese). We identified strong evidence of associations between PCOS and three loci: 2p16.3 (rs13405728; combined P-value by meta-analysis P(meta) = 7.55 × 10(-21), odds ratio (OR) 0.71); 2p21 (rs13429458, P(meta) = 1.73 × 10(-23), OR 0.67); and 9q33.3 (rs2479106, P(meta) = 8.12 × 10(-19), OR 1.34). These findings provide new insight into the pathogenesis of PCOS. Follow-up studies of the candidate genes in these regions are recommended.