遗传与变异，是物种形成和生物进化的基础。遗传物质脱氧核糖核酸（DNA）通过亲代传递给子代，使后代呈现与前代相近的性状，保持物种的相对稳定。同时，亲代与子代、子代个体之间也有差异，并不是完全相同，这种现象称为变异。遗传使得物种得以延续，变异促使物种不断进化。变异分为可遗传变异和不可遗传变异。前者主要是指基因突变、基因重组与染色体变异。其中基因突变是产生新生物基因的根本来源，是产生生物多样性的根本来源。不可遗传变异是指受外界因素如光照、水源等影响产生的变异。
        遗传标记是指可用来追踪遗传物质轨迹的任何一种遗传特性，在遗传变异的研究中起着重要的作用。遗传标记的发展经历了形态学标记、细胞学标记、生物化学标记和分子标记四个阶段。形态标记是指肉眼可见的或经仪器测量的外部特征，如毛色、体型、皮肤结构等；细胞遗传标记是指个体染色体数目和形态的特征，如染色体核型和带型及缺失、重复、易位、倒位；生物化学标记是以生物体内的某些生化性状为遗传标记，如血型、血清蛋白及同工酶；分子标记是以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是 DNA 水平遗传多态性的直接反映，具有很大的优越性：多态性高，变异极其丰富；不影响目标性状的表达；具有很高的稳定性。因此，目前分子标记已广泛应用于作物遗传育种、基因组作图、亲缘关系鉴定、疾病基因组学、进化遗传学等领域的研究。