英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

The pervasive effects of   an antibiotic on the human gut microbiota,   as revealed by deep 16S rRNA sequencing

PLoS Biology

4.587 

2008

个人在服用环丙沙星前后粪便样本

细菌16S rDNA V3，V6区测序

Towards the Human   Colorectal Cancer Microbiome

Plos one

3.057

2011

来自6个接受了切除手术的原发性结肠腺癌患者癌组织和和癌旁粘膜样品

细菌16S rDNA V1-V3区测序

Structural segregation of gut   microbiota between colorectal cancer patients and healthy   volunteers

The ISME Journa

9.328

2012

46例结直肠癌患者和56例健康对照志愿者的粪便样品

细菌16S rDNA V3区测序

Co-occurrence of   driver and passenger bacteria in human colorectal cancer

Gut Pathogens

2.816 

2014

正常肠道组织样本（ｎ＝10），腺瘤性息肉组织样本（ｎ＝10），肿瘤组织样本（ｎ＝8）

细菌16S rDNA V1-V2区测序

Impacts of   infection with different toxigenic Clostridium difficile strains on faecal   microbiota in children

Scientific Reports 

5.228

2014

28-48月大的14个 (CDAD A+B+)感染儿童，23个 (CDAD A–B+)感染儿童，43个健康儿童粪便

细菌16S rDNA V1-V3区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

Insights   into the respiratory tract microbiota of patients with cystic   fibrosis during early Pseudomonas aeruginosa colonization

Springer Plus

0.982 

2015

5个囊性纤维化患者16–39 个月的20个痰样本

细菌16S rDNA V3-V4区测序

Composition and   dynamics of the respiratory tract microbiome in intubated patients

Microbiome

9.0

2016

15个呼吸衰竭受试者的上呼吸道口咽和深部气管分泌物样本

细菌16S rDNA V6区测序

Dysbiosis of upper respiratory tract   microbiota in elderly pneumonia patients

The ISME Journa

9.328

2016

100位年龄》60岁的老年肺炎患者，27位年龄18岁-60岁的青年肺炎患者；91位健康的老年人和187位健康的青年人的口咽样本

细菌16S rDNA V5-V7区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

Temporal and   spatial variation of the human microbiota during pregnancy

PNAS

9.423 

2015

49名18岁及以上的孕妇每一周以及产后的阴道、大便、唾液和牙齿/牙龈样本

细菌16S rDNA扩增子测序

Cervicovaginal   Bacteria Are a Major Modulator of Host Inflammatory Responses in the Female   Genital Tract

Immunity

24.082

2015

94个无症状妇女阴道阴道棉签擦拭样品

细菌16S rDNA V4区扩增子测序

Metabolicsignatures   of bacterial vaginosis

mBIO

6.786

2015

40个健康女性和20个细菌性阴道炎患者的聚氨酯泡沫拭子、阴道灌洗液、子宫颈灌洗液

细菌16S rDNA V3-V4区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

A Filifactor   alocis-centered co-occurrence group associates with periodontitis across   different oral habitats

Scientific Reports 

5.228

2015

牙周炎患者和健康志愿者的唾液，牙龈上菌斑，牙龈下菌斑样品

细菌16S rDNA V3-V4区测序

Prediction of Early   Childhood Caries via Spatial-Temporal Variations of Oral Microbiota

Cell Host   & Microbe

12.552

2015

未患龋齿儿童；患有轻微龋齿儿童；患有严重龋齿儿童的唾液和牙菌斑样品

细菌16S rDNA V1-V3区测序

Cigarette smoking   and the oral microbiome in a large study of American adults

The ISME Journal

9.328

2016

从未吸过烟的志愿者；有过吸烟史但已戒烟的志愿者；一直吸烟志愿者的口腔样本

细菌16S rDNA V3-V4区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

Topographic persity   of fungal and bacterial communities in human skin

Nature

38.138 

2013

十位健康成年人身上收集的易发生真菌性皮肤病的十四个皮肤部位拭子样本

细菌16S rDNA V3-V4区测序；真菌18SrDNA V1-V6区扩增子测序，；真菌ITS1扩增子测序

Intestinal   microbiome analyses identify melanoma patients at risk for   checkpoint-blockade-induced colitis

Nature communications

11.329 

2016

34名患黑色素瘤并且接受依普利姆玛治疗的病人粪便样本（24名没有患肠炎；10名患肠炎组）

细菌16S rDNA V4-V5区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

Decreased Bacterial   Diversity Characterizes the Altered Gut Microbiota in Patients With Psoriatic   Arthritis, Resembling Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease

Arthritis Rheumatol

6.009

2015

17个银屑病关节炎患者，15个牛皮癣患者，17个健康志愿者粪便样品

细菌16S rDNA V1-V2区测序；

Intestinal   Dysbiosis in Ankylosing Spondylitis

Arthritis Rheumatol

6.009

2015

9个强直性脊柱炎患者，9个健康对照的粪便样品

细菌16S rDNA V4区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

Human oral, gut,   and plaque microbiota in patients with atherosclerosis

PNAS

9.423 

2015

15个正常人和15个动脉粥样硬化患者的动脉粥样硬化斑块，肠道，口腔样本

细菌16S rDNA V1-V2区测序

Microbiota Dysbiosis   Controls the Neuroinflammatory Response after Stroke

The Journal of Neuroscience

5.924 

2016

诱导中风小鼠和正常小鼠的粪便样本

细菌16S rDNA V1-V3区测序

Commensal   microbiota affects ischemic stroke outcome by regulating intestinal γδ T   cells

Nature medicine

30.357 

2015 

利用抗生素清除肠道微生物后的小鼠和一组对照小鼠的粪便样本，然后中风诱导

细菌16S rDNA V4-V5区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

Reduced diversity   and altered composition of the gut microbiome in individuals with myalgic   encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome

Microbiome

9.0

2016

48例肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者和39例对照受试者的粪便样品

细菌16S rDNA V4区测序

Reduced incidence   of Prevotella and other fermenters in intestinal microflora   of autistic children

Plos one

3.057

2013

20名正常人和20个自闭症儿童的粪便样品

细菌16S rDNA V2-V3区测序

Fecal microbiota   and metabolome of children with autism and pervasive   developmental disorder not otherwise specified

Plos one

3.057

2013

10名广泛性发展障碍儿童，10名自闭症儿童和10名正常儿童粪便样本

细菌16S rDNA V1-V3区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

The Microbiome of   Aseptically Collected Human Breast Tissue in Benign and Malignant Disease

Scientific Reports 

5.228

2016

乳腺癌患者和良性肿瘤的乳腺组织，乳房皮肤组织，乳房皮肤和口腔黏膜样品

细菌16S rDNA V3-V5区测序

The microbiota of   breast tissue and its association with tumours 

Appl.Environ. Microbiol.

3.823

2016

乳腺癌患者癌旁正常组织和健康对照组的组织

细菌16S rDNA V6区测序

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

A core gut microbiome in obese and lean twins

Nature

38.138 

2009

胖瘦不同的同卵双胞胎（31对）、异卵双胞胎（23对）及其母亲（46个）的粪便样本

细菌16S rDNA V2,V6区测序

Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

Plos one

3.057

2010

Ⅱ型糖尿病男性患者18人，正常男性18人的粪便样本

细菌16S rDNA V4-V6区测序

Fecal microbiota   imbalance in Mexican children with type 1 diabetes

Scientific Reports 

5.228

2014

8 例健康儿童，8 例初发 I 型糖尿病患者，

以及 13 例已治疗两年的 I 型糖尿病患者的粪便样本

细菌16S rDNA V4区测序

The stool   microbiota of insulin resistant women with recent gestational diabetes, a   high risk group for type 2 diabetes

Scientific Reports 

5.228

2015

分娩3-16个月后的42名妊娠期糖尿病患者和35名健康者粪便样品

细菌16S rDNA V4区测序